1、体质因素
婴幼儿胃肠道发育不够成熟，酶的活性较低，但营养需要相对较多，胃肠道负担重；
婴幼儿时期神经、内分泌、循环系统及肝肾功能发育均未成熟，调节机能较差；
婴幼儿免疫功能也不完善，血清大肠杆菌抗体滴度在出生至2周岁最低，以后逐渐升高。婴幼儿期易患大肠杆菌肠炎。母乳中大肠杆菌抗体滴度高，母乳喂养的婴幼儿发病率较低，患病也较轻。同样的道理，婴幼儿的轮状病毒抗体低，同一集体流行时，较小的婴幼儿罹病多。
婴幼儿体液分布和成人不同，细胞外液体占比例较高，并且婴幼儿水分代谢旺盛，调节功能又差，较易发生体液、电解质紊乱。婴幼儿易患佝偻病和营养不良，更容易导致消化功能紊乱，腹泻后容易迁延。
2、感染因素
消化道内感染，致病微生物随着污染的食物、水进入婴幼儿消化道，或者哺喂时所用器皿或食物本身未经消毒或消毒不够，也会造成感染。病毒也可通过呼吸道或水源感染。婴幼儿腹泻主要以消化道内感染为主要原因。
消化道外感染，如中耳炎、咽炎、肺炎、泌尿道感染和皮肤感染等引起腹泻。此类引起的腹泻一般都不严重，年龄越小越多见。
还有滥用抗生素所导致的肠道菌群紊乱，如氯霉素、卡那霉素、庆大霉素、氨苄青霉素、各种头孢霉素，特别是两种或以上并用时，除可直接刺激肠道或刺激植物神经引起肠蠕动增快、葡萄糖吸收减少、双糖酶活性降低而发生腹泻外，更严重的可引起肠道菌群紊乱，同时耐药性金黄色葡萄球菌、变形杆菌、绿脓杆菌、白色念珠菌等可大量繁殖，引起药物较难控制的肠炎。
3、消化功能紊乱
消化道功能紊乱主要有饮食因素、不耐受碳水化物、食物过敏、药物影响造成。以及如，不清洁的环境、户外活动较少、生活规律的突然改变、外界气候的突变等也易引起婴幼儿腹泻。
腹泻的原因不同，腹泻的表现方式和持续的时间也不尽同。腹泻可分为急性腹泻和慢性腹泻。
1、急性腹泻，是指腹泻时间在2周以内。
因饮食原因，如奶粉稀释不当、水温不合适，饮食过多的果汁等原因造成的急性腹泻，一般在调整饮食后3天左右大便就会正常。所以，尽量喝不含糖分或少量糖分的水、饮料或果汁。
因各种不同的病菌导致的，如最常见的轮状病毒引起的肠炎，典型症状就是稀水便，水便分离。大便次数很多，量也很大，尤其是小一点的婴幼儿大便可能会顺着屁股和腿往下流。很容易造成严重脱水和电解质紊乱。轮状病毒感染的肠炎还可以继发，造成婴幼儿心脏的损伤。
因细菌感染，如痢疾杆菌、大肠杆菌、沙门氏菌引起的腹泻。严重的腹泻还会出现发高烧或伴随呕吐、腹痛、粘液脓血便等。
2、慢性腹泻，是指腹泻时间长于2周的迁延性腹泻和腹泻时间多于2个月的慢性腹泻。
婴幼儿腹泻的临床主要表现为：大便次数增多，排稀便和水电解质紊乱。长期慢性腹泻还会导致营养发育不良、体重不增等。
同时，腹泻也常导致营养不良、多种维生素缺乏和多种感染，我们称之为腹泻并发症。如消化道外感染、鹅口疮、中毒性肝炎等。
消化外外感染，常因腹泻后全身抵抗力低下而受感染。常见的有皮肤化脓性感染、泌尿道感染、中耳炎、上呼吸道感染、支气管炎、肺炎、静脉炎和败血症。病毒性肠炎偶有并发心肌炎。
鹅口疮，病程迁移或原有营养不良的患儿易并发鹅口疮，尤其是长期使用广谱抗生素后更多。
中毒性肝炎，腹泻病程中可出现黄疸，多见于原有营养不良的患儿。也有大肠杆菌引起的肠炎，并发中毒性肝炎
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